АО «Центр внедрения современных медицинских технологий» Медицинского центра Управления делами Президента Республики Казахстан» (далее – Центр) было создано в соответствии с постановлением Правительства Республики Казахстан от 25 декабря 1998 года № 1355 «Вопросы учреждений-администраторов программ, финансируемых из государственного бюджета» приказом Медицинского центра УДП РК от 17.02.1999г. № 25 «О создании ГУ «Центр внедрения современных медицинских технологий Медицинского центра Управления делами Президента Республики Казахстан».
4 декабря 2007 года постановлением Правительства Республики Казахстан № 1174 «О реорганизации государственного учреждения «Центр внедрения современных медицинских технологий» Медицинского центра Управления делами Президента Республики Казахстан» Государственное учреждение «Центр внедрения современных медицинских технологий» реорганизовано в Республиканское государственное казенное предприятие.
В соответствии с постановлением Правительства Республики Казахстан от 12 марта 2009 года № 289 «О реорганизации отдельных организаций Управления делами Президента Республики Казахстан» РГКП «Центр внедрения современных медицинских технологий» Медицинского центра Управления делами Президента Республики Казахстан реорганизовано в Республиканское государственное предприятие на праве хозяйственного ведения, осуществляющий производственно-хозяйственную деятельность в области здравоохранения и науки.